理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センターで構築しているThe single-cell data integration platform (一細胞データ統合プラットフォーム)は理研や世界の研究コミュニティによる一細胞データを統合し、容易に利用できるようにしたデータベースです。このデータベースの特徴は、様々なプロトコルやシーケンサーを用いて行われた一細胞の研究プロジェクトにより得られた配列情報、画像情報、メタデータを統合している点です。

現在このプラットフォームでは、メタデータに対するキーワード検索を用いた、データセット、細胞、RNA-Seqデータの検索や、遺伝子名による発現量の検索が可能です。今後、理研の一細胞プロジェクトや世界中の研究プロジェクトで得られたデータの追加、インタフェースの改良、これらのデータを用いた解析結果の提供などを計画しています。

データベースは以下からご覧いただけます:
http://single-cell.clst.riken.jp/

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ライフサイエンス技術基盤研究センター
機能性ゲノム解析部門
大容量データ管理技術開発ユニット
ユニットリーダー 粕川 雄也
email: takeya.kasukawa@riken.jp